V rámci magisterského studijního programu Farmacie zajišťuje výuku pěti na sebe navazujících předmětů. Vedle dvou stěžejních disciplín farmaceutického studia to je také jeden povinně volitelný předmět a dva volitelné předměty. Forma teoretické i praktické výuky je velmi široká a zahrnuje přednášky, semináře, praktická cvičení, případně i exkurze do zdravotnických, resp. výrobních zařízení. Výuka magisterského studijního programu Farmacie probíhá jednak v českém, jednak v anglickém jazyce.
V rámci bakalářského studijního programu Laboratorní diagnostika ve zdravotnictví je vyučován jeden povinný a jeden volitelný předmět. V navazujícím magisterském studijním programu Bioanalytická Laboratorní diagnostika ve zdravotnictví jsou vyučovány dva volitelné předměty. Důležitou součástí výuky katedry jsou bakalářské a diplomové práce, převážně experimentálního charakteru. Ročně vypracuje na katedře diplomovou práci okolo dvaceti studentů.
Vedle magisterského a bakalářského studijního programu katedra zabezpečuje i studium dvou stejnojmenných oborů doktorského studijního programu.
Doktorské studium
V doktorském studiu jsou na katedře akreditovány programy: