Studijní program Lékařská a farmaceutická mikrobiologie

Doktorský studijní program Lékařská a farmaceutická mikrobiologie

1. Základní informace
2. Přijímací zkoušky
3. Rámcový studijní plán
4. Personální zabezpečení
5. Výzkumné skupiny

1. Základní informace

• forma studia: prezenční / kombinovaná
• počet přijímaných studentů do dané formy: 2 / 1
• jazyk výuky: český / anglický
• standardní doba studia: 4 roky
• forma přijímací zkoušky: ústní
• platnost akreditace: do 29. 11. 2033
• oblast vzdělávání: Všeobecné lékařství a zubní lékařství (70 %), Farmacie (30 %)
• zajišťující fakulta: LF HK UK, FaF UK
• garanti programu: prof. MUDr. Pavel Boštík, Ph.D., doc. PharmDr. Mgr. Martin Krátký, Ph.D.

Charakteristika programu

Absolvent studijního programu Lékařská a farmaceutická mikrobiologie získá teoretické a praktické dovednosti, které bude schopen dále samostatně rozvíjet a aplikovat při samostatné vědecké a tvůrčí činnosti v oboru. Absolvent si osvojí poznatky z oboru lékařské mikrobiologie, antimikrobiální farmakoterapie, designu antimikrobiálních látek, molekulární diagnostiky a epidemiologie, proteomiky a genomiky. Bude schopen samostatně formulovat vědecké hypotézy, aplikovat vhodné postupy a řešení pro dosažení cílů řešení, a zejména kriticky zhodnotit a diskutovat získané výsledky, včetně jejich prezentace. Absolvent chápe širší souvislosti zkoumaného problému, je schopen v kontextu své vědecké práce navázat interdisciplinární spolupráci.

Informace o uplatnění absolventů

Cílem studia je příprava na vysoce kvalifikovanou výzkumnou práci s hlubokými teoretickými a praktickými znalostmi v oblasti xenobiochemie, patobiochemie a biochemických věd v rámci humánní medicíny a farmacie a dobrými znalostmi dalších biochemických věd a příbuzných vědních oborů z oblasti farmacie, biologie a medicíny. Jádrem programu je realizace vlastního výzkumného projektu založeného na experimentální laboratorní práci, jehož výsledky jsou publikovány na mezinárodní úrovni a jsou shrnuty v disertační práci. Studium je zaměřeno na biochemické discipliny s důrazem na interakci xenobiotik s molekulami organismu, na biochemii patologických stavů včetně klinickobiochemických aspektů.

2. Přijímací zkoušky

Rámcový obsah ústní přijímací zkoušky

Ústní zkouška z mikrobiologie, problematiky antimikrobních látek, mikrobiologických vyšetřovacích metod se zaměřením podle dosavadního studia a oblasti tématu disertační práce.

Podmínky přijetí

Podmínkou přijetí ke studiu v doktorském studijním programu je řádné ukončení studia v magisterském studijním programu.

Doplňující podmínky pro bonifikaci (např. praxe)

• Řádně ukončené studium v magisterském studijním programu v oblasti medicíny, farmacie, biologie, přírodních věd (hodnoceno 2 body).
• Praxe v laboratoři, publikační aktivita, práce v oblasti výzkumu (hodnoceno 3 body).
• Uvedení předpokládaného školícího pracoviště a uvedení souhlasu konkrétního školitele s vedením plánovaného doktorandského projektu (hodnoceno max. 5 body).

Kritéria pro vyhodnocení přijímací zkoušky

1. Úroveň odborných znalostí – posouzena na základě odpovědí na otázky z okruhu témat uvedených v Rámcovém obsahu přijímací zkoušky (lze získat max. 10 bodů)
2. Předložený doktorandský výzkumný projekt – hodnocena je komplexnost projektu, moderní metodické přístupy pro jeho řešení a návaznost projektu na již řešená témata v oborové radě (lze získat max. 10 bodů)

Minimální bodová hranice pro přijetí je 20 bodů ze 30.

Děkan rozhodne o přijetí toho/těch uchazeče/uchazečů, který/kteří splnil/i podmínky přijímacího řízení a zároveň se podle počtu dosažených bodů umístil/i v pořadí odpovídajícím předem stanovenému předpokládanému počtu přijímaných uchazečů pro konkrétní program.

Termíny

• termíny a detailní informace o přijímacím řízení
• aktuálně vypsaná témata disertačních prací

3. Rámcový studijní plán

Studijní povinnosti

Student je povinen absolvovat povinné předměty:

• Základy vědecké práce (společné pro všechny DSP)
• Minimálně 1 specifický oborový předmět, název a specifikace stanoví garant DSP
• Klinická mikrobiologie
• Laboratorní metody v mikrobiologii

Student se aktivně účastní odborných akcí v ČR a zahraničí s prezentací samostatně dosažených výsledků. Publikuje v zahraničních impaktovaných odborných periodicích.

Povinnosti a obsah doktorského studia jsou každému studentovi určeny individuálním studijním plánem (ISP), včetně časového harmonogramu, jehož plnění podléhá pravidelnému vyhodnocení OR.

Požadavky na tvůrčí činnost

Minimální požadavek na publikační tvůrčí činnost studenta DSP pro zahájení řízení k obhajobě disertační práce je stanoven takto:

• Student musí být autorem nebo spoluautorem nejméně 2 recenzovaných odborných prací tematicky spjatých s tématem disertační práce přijatých k publikaci v časopisech s IF ≥ 0,5 (posuzováno k měsíci přijetí práce), přičemž alespoň u jedné originální, původní vědecké práce je student prvním autorem.

nebo

• Student musí být prvním autorem originální vědecké práce tematicky spjaté s tématem disertační práce přijaté k publikaci v době studia v časopise s IF, který je zařazen v Q1 dle aktuálního ukazatele AIS (posuzováno k měsíci přijetí práce). V případě zařazení daného časopisu do více oborů dle WoS se bude počítat Q1 dle AIS pro obor disertační práce.

Do počtu povinných publikací nelze zařadit publikace typu „letter to editor“, diskuse k jiné vědecké práci, „short communication“, editorial etc. Kvalitu a případnou uznatelnost (přijatelnost) publikace, která nesplní typ výše uvedených původních vědeckých prací pod a) nebo b), ale bude se jednat o publikaci velmi významnou (patent, novou metodiku, vysoce kvalitní přehledovou publikaci apod.), posoudí OR a proděkan pro DSP.

Požadavky na absolvování stáží

Student v průběhu studia absolvuje stáž na zahraničním pracovišti v celkové době nejméně tři měsíce, kdy je možné dělení této doby na maximálně tři části. Během stáže student řeší část svého výzkumného projektu a konzultuje, rozvíjí a analyzuje výsledky výzkumu a související témata související s disertační prací.

Další studijní povinnosti

Hodnocení průběhu studia se standardně provádí v rámci čtyř milníků – průběžných hodnocení studia s kontrolou splnění studijních povinností, což nezávisle na školiteli hodnotí OR:

1. po 6 měsících studia od začátku studia - student předloží minimálně 5 stránkový (A4) popis výzkumného projektu k tématu svého studia s jasnou deklarací aktuálního stavu problematiky, hypotéz, vědecké otázky, hlavních a vedlejších cílů výzkumného projektu (práce), používaných metod, předpokládaného vědeckého přínosu a finanční rozvahy. Do výše uvedeného rozsahu popisu se nepočítá přehled literárních zdrojů. Tento požadavek může být splněn podáním grantu GAUK či ekvivalentního vědeckého projektu v 1. úseku studia;

2. nejpozději do konce prvního roku studia student prezentuje stav dosažených výsledků a zvládnutých metod formou zápisu do SIS;

3. nejpozději do konce druhého roku studia student prezentuje data z výzkumu zpracovaná statistickými metodami a předloží kopii sepsané žádosti o grantovou podporu řešení svého výzkumného projektu nebo doloží aktivní zapojení do grantového projektu školitele a zanese do SIS;

4. nejpozději do konce čtvrtého roku studia student předloží prvoautorský rukopis původní vědecké práce, který je ze strany školitele připravený k odeslání do časopisu s IF ≥ 0,5 a vloží do SIS a současně doloží přehled prezentací výsledků řešení svého výzkumného projektu na odborných vědeckých akcích.

   Z výše uvedeného vyplývají následující povinnosti studenta a jejich zavedení do SIS:

   • předložení vlastního výzkumného projektu k tématu disertační práce,
   • předložení samostatného návrhu žádosti o grantovou podporu nebo aktivní zapojení do grantu školitele,
   • prezentace výsledků vlastní vědecké práce na odborné akci/konferenci v pozici prezentujícího autora,
   • připravení prvoautorského rukopisu původní vědecké práce, která je tématem jeho disertační práce, do časopisu s IF vyšším než 0,5.

Témata disertačních prací

• Témata obhájených disertačních prací - Repozitář závěrečných prací
• Aktuálně vypsaná témata disertačních prací

Státní doktorská zkouška

Státní doktorská zkouška se zaměřuje na vědní základ oboru a disciplín souvisejících s tématem disertační práce. Státní doktorská zkouška bude provedena formou pohovoru se zaměřením na širší oblasti výzkumu doktoranda spolu s obhajobou disertační práce.

4. Personální zabezpečení

Oborová rada

Předseda a garant studijního programu

• prof. MUDr. Pavel Boštík, Ph.D.,

Místopředseda a garant studijního programu pro FaF UK

• doc. PharmDr. Mgr. Martin Krátký, Ph.D.

Členové oborové rady

• prof. PharmDr. Martin Doležal, Ph.D.
• doc. MUDr. Miroslav Fajfr, Ph.D.
• prof. MUDr. Roman Chlíbek, Ph.D.
• prof. MUDr. Marian Kacerovský, Ph.D.
• prof. MUDr. Milan Kolář, Ph.D.
• prof. MUDr. Filip Růžička, Ph.D.
• prof. MUDr. Pavel Žák, Ph.D.
• prof. MUDr. Helena Žemličková, Ph.D.

Další školitelé mimo členy OR

• doc. RNDr. Vladimír Buchta, CSc.
• RNDr. Eva Čermáková
• MUDr. Miroslav Fajfr, Ph.D.
• prof. Ing. Zdeněk Fiala, CSc.
• doc. Ing. Josef Hanuš, CSc.
• doc. Ing. Miloš Hroch, Ph.D.
• doc. Ing. Jaroslav Chládek, Ph.D.
• PharmDr. Ondřej Janďourek, Ph.D.
• prof. MUDr. RNDr. Milan Kaška, Ph.D.
• RNDr. Klára Konečná, Ph.D.
• prof. RNDr. Jan Krejsek, CSc.
• prof. Ing. Jan Kremláček, Ph.D.
• doc. MUDr. Otto Kučera, Ph.D.
• Mgr. Rudolf Kukla, Ph.D.
• prof. MUDr. Stanislav Mičuda, Ph.D.
• prof. MUDr. Jaroslav Mokrý, Ph.D.
• prof. PharmDr. Petr Nachtigal, Ph.D.
• MUDr. Pavla Paterová, Ph.D.
• PhDr. Olga Pitašová
• prof. PharmDr. Emil Rudolf, Ph.D.
• prof. MUDr. Aleš Ryška, Ph.D.
• MUDr. Lenka Ryšková, Ph.D.
• prof. MUDr. Martina Řezáčová, Ph.D.
• Mgr. Iva Selke - Krulichová, Ph.D.
• doc. MUDr. Ilja Tachecí, Ph.D.

5. Výzkumné skupiny vedené školiteli v rámci doktorského studijního programu Lékařská a farmaceutická mikrobiologie

Syntézy potenciálních léčiv a studium vztahů mezi jejich chemickou strukturou, biologickou aktivitou a toxicitou

Návrh a vývoj nových antimikrobiálních léčiv
Vedoucí: prof. PharmDr. Martin Doležal, Ph.D.