Organizační struktura fakulty
Samosprávu fakulty vykonávají členové akademické obce fakulty přímo nebo prostřednictvím samosprávných akademických orgánů. Dalším orgánem fakulty je tajemník.
Samosprávné orgány
Akademický senát
Děkan
Vědecká rada fakulty
Disciplinární komise
Další orgány
Poradní orgány děkana
Kolegium děkana
Rozšířené kolegium děkana
Další poradní orgány, komise
Děkanát
Sekretariát děkana
Studijní oddělení
Vědecké oddělení
Oddělení vnějších a mezinárodních vztahů
Oddělení grantové podpory a strategického rozvoje
Ekonomické oddělení
Personální a mzdové oddělení
Investiční a provozně-technické oddělení
Správní oddělení
Oddělení informačních systémů
Útvary
Útvar interního auditu
Centrum informačních technologií
Pomoc a podpora
Fakulta se člení na katedry a další pracoviště. Fakultní pracoviště zřizuje děkan po vyjádření Vědecké rady fakulty a se souhlasem Akademického senátu fakulty.
Katedry
Katedra biofyziky a fyzikální chemie
Katedra organické a bioorganické chemie
Katedra analytické chemie
Katedra biochemických věd
Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy
Katedra farmaceutické technologie
Katedra farmakognozie a farmaceutické botaniky
Katedra biologických a lékařských věd
Katedra farmakologie a toxikologie
Katedra sociální a klinické farmacie
Katedra tělesné výchovy
Katedra analytické chemie a farmaceutické analýzy
Katedra farmaceutické chemie
Střediska
Zahrada léčivých rostlin
Středisko vědeckých a knihovnických informací
České farmaceutické muzeum
Dětská skupina Fafík
Centrum programu MEPHARED 2
Vivárium
Provozně-technický úsek
Centrální přístrojová laboratoř
Radiofarmaceutická laboratoř