Doctoral Dissertation Themes

Integrating mathematical modeling and experimental approaches in in vitro biology

Cílem výzkumného projektu je vyvinout a optimalizovat mechanistické matematické modely in vitro biologických systémů, kalibrovat tyto modely na experimentální data, a predikovat/charakterizovat chování těchto systémů při měnících se vstupních parametrech. Metody, které budou použity zahrnují obyčejné a/nebo parciální diferenciální rovnice, algoritmizace modelů v prostředí MATLAB/Python, metody numerické optimalizace a inference (MCMC), metody analýzy citlivosti, strukturální a praktické identifikovatelnosti parametr, případně dalších pokročilých statistických metod. Student bude mít možnost si vybrat oblast aplikace, a to buď virologii nebo farmakologii.

Supervisor: Mgr. Veronika Bernhauerová, Ph.D.

Keywords: matematický model, fitování experimentálních dat, diferenciální rovnice, numerické simulace