Doktorský studijní program Xenobiochemie a patobiochemie
- Základní informace
- Přijímací zkoušky
- Rámcový studijní plán
- Personální zabezpečení
- Výzkumné skupiny
1. Základní informace
- Forma studia: prezenční / kombinovaná
- Jazyk výuky: český / anglický
- Standardní doba studia: 4 roky
- Forma přijímací zkoušky: ústní
- Platnost akreditace: do 22. 05. 2029
- Zajišťující fakulta: FaF UK
- Oblast vzdělávání: Farmacie (100 %)
Charakteristika programu
Cílem studia je příprava na vysoce kvalifikovanou výzkumnou práci s hlubokými teoretickými a praktickými znalostmi v oblasti xenobiochemie a patobiochemie a dobrými znalostmi dalších biochemických věd a příbuzných vědních oborů z oblasti farmacie, biologie a medicíny. Jádrem programu je experimentální laboratorní práce, jejíž výsledky jsou publikovány a jsou obsaženy v disertační práci.
Studium je zaměřeno na biochemické discipliny s důrazem na interakci xenobiotik s molekulami organismu a na biochemii patologických stavů včetně klinickobiochemických aspektů.
Informace o uplatnění absolventů
Absolvent doktorského studia v programu Xenobiochemie a patobiochemie je po obhajobě dizertační práce kvalifikován pro výzkumnou a odbornou práci v laboratořích s biochemickým zaměřením, pro akademickou kariéru vysokoškolského učitele v oboru biochemických disciplín a pro vysoce odbornou práci ve farmaceutických a bioanalytických firmách. Je připraven se v těchto disciplínách průběžně vzdělávat a rozšiřovat své znalosti v souladu s novými poznatky oboru.
2. Přijímací zkoušky
Rámcový obsah ústní přijímací zkoušky
Ústní zkouška z biochemie, molekulární biologie, chemie se zaměřením podle dosavadního studia, diplomové práce a očekávaného zaměření budoucího doktorského studia.
Část zkoušky v anglickém jazyce pro posouzení znalosti angličtiny (alespoň znalost na úrovni B2 je podmínkou).
Podmínky přijetí
- Ukončení požadovaného předchozího studia, tj. řádné ukončení studia v magisterském studijním programu
- Úspěšné složení přijímací zkoušky
Kritéria pro vyhodnocení přijímacích zkoušek
- Úroveň odborných znalostí – posouzena na základě odpovědí na otázky z okruhu témat uvedených v Rámcovém obsahu přijímací zkoušky (lze získat max. 10 bodů)
- Předložený doktorandský projekt – hodnocena je komplexnost projektu, moderní metodické přístupy pro řešení a návaznost projektu na již řešená témata v oborové radě (lze získat max. 10 bodů)
Minimální bodová hranice pro přijetí je 20 bodů.
Děkan rozhodne o přijetí toho/těch uchazeče/uchazečů, který/kteří splnil/i podmínky přijímacího řízení a zároveň se podle počtu dosažených bodů umístil/i v pořadí odpovídajícím předem stanovenému předpokládanému počtu přijímaných uchazečů pro konkrétní program.
Doplňující podmínky pro bonifikaci (např. praxe)
- Řádně ukončené studium v magisterském studijním programu v oblasti farmacie, medicíny, biologie, chemie (hodnoceno 2 body).
- Praxe v oboru (hodnoceno 3 body).
- Uvedení předpokládaného školícího pracoviště a uvedení souhlasu konkrétního školitele s vedením plánovaného doktorandského projektu (hodnoceno max. 5 body).
Termíny
3. Rámcový studijní plán
Studijní povinnosti
Studijní plán je připravován individuálně podle zaměření experimentální práce a rovněž předchozího vzdělání doktoranda. Zahrnuje kurzy a konzultace, absolvování dílčích zkoušek z angličtiny a nejméně ze tří dalších odborných předmětů z následujícího seznamu v souladu se zaměřením experimentální práce a předchozího vzdělání doktoranda tak, aby vzdělání v oboru bylo co nejúplnější, s důrazem na hloubku v oblasti zaměření experimentální disertační práce.
Seznam odborných předmětů:
- Patobiochemie
- Xenobiochemie
- Enzymologie
- Vybrané kapitoly z obecné biochemie
- Vybrané kapitoly z farmakologie a toxikologie
- Molekulární biologie
- Laboratorní techniky v biochemii
- Základy praktické bioinformatiky
Nutnou podmínkou je absolvování dílčích zkoušek z profilových předmětů oboru, tj. xenobiochemie a patobiochemie (pokud tyto předměty student absolvoval v rámci magisterského studia, znovu si je nezapisuje, místo nich si zapíše jiné předměty) a angličtiny.
Teprve po absolvování dílčích zkoušek následuje povinná státní doktorská zkouška. Plnění individuálního studijního plánu je průběžně sledováno.
Požadavky na tvůrčí činnost
Na začátku studia doktorand připraví, zpravidla v součinnosti se svým školitelem, návrh grantového projektu pro GAUK. V průběhu studia pak doktorand aktivně prezentuje své dosažené výsledky na odborných setkáních (semináře, doktorandské konference, kongresy, vědecké konference).
Požadováno je spoluautorství studenta na 2 publikacích v časopisech s IF, z nichž alespoň u jedné práce je student prvním autorem. Případně je možné publikovat jen 1 prvoautorskou publikaci v časopise s IF nad 5 a/nebo v prvním decilu.
Požadavky na absolvování stáží
Nedílnou součástí studijních povinností v doktorském studijním programu je absolvování alespoň jedné zahraniční stáže v souhrnné délce nejméně tří měsíců, spojené s experimentální výzkumnou prací v oblasti disertační práce.
Další studijní povinnosti
Možné je zapojení do výuky předmětu Obecná biochemie, Základy biochemie, Molekulární biologie, Praktická cvičení z xenobiochemie nebo Patobiochemie (praktická cvičení, popř. semináře), případně do další praktické výuky zajišťované školícím pracovištěm, maximálně však 6 hodin týdně, 24 hodin měsíčně.
Témata disertačních prací
- Příklady témat obhájených disertačních prací
- Antracyklinová rezistence v nádorových buněčných liniích navozená reduktasami z nadrodiny Aldo-ketoreduktas.
- Environmentální rizika anthelmintik
- Exosomy hlístic v interakci parazit-hostitel
- In vitro, a in vivo modelování monodruhových a polydruhových mikrobiálních biofilmů pro studium intervence látkami s anti-infekčním potenciálem
- Studium aktivity ftalocyaninových fotosensitizérů použitím 2D a 3D in vitro modelů a in vivo myšího modelu nádorových onemocnění a stanovení mechanismu jejich účinku.
- Úloha karbonylreduktáz v metabolismu vlasovky slezové
- Úloha signální dráhy Hedgehog/GLI a role nádorových kmenových buněk při vzniku a progresi vybraných nádorových typů.
- Vliv inhibice reduktasy AKR1C3 prostřednictvím inhibitorů tyrosinkinas na její interakci s androgenním receptorem v buňkách rakoviny prostaty.
- Význam tkáňového a solubilního endoglinu v patogenezi kardiometabolických nemocí.
Státní doktorská zkouška
Tématické okruhy jednotlivých disciplín jsou obvykle specifikovány v souladu se zaměřením disertační práce. Zkoušený doktorand dostane v průběhu státní zkoušky zpravidla (nejméně) 3 témata, na kterých prokáže svou odbornou znalost. Témata se vždy dotýkají oblasti xenobiochemie a patobiochemie, další směrování závisí na zaměření disertační práce.
4. Personální zabezpečení
Oborová rada
Předseda a garant studijního programu
- prof. Ing. Vladimír Wsól, Ph.D.
Členové oborové rady
- prof. RNDr. Zuzana Bílková, Ph.D.
- doc. PharmDr. Iva Boušová, Ph.D.
- prof. RNDr. Petr Hodek, CSc.
- doc. Ing. Petra Matoušková, Ph.D.
- prof. MUDr. Martina Řezáčová, Ph.D.
- prof. RNDr. Lenka Skálová, Ph.D.
- prof. MUDr. Jiří Stulík, CSc.
- prof. Ing. Barbora Szotáková, Ph.D.
- prof. PharmDr. Tomáš Šimůnek, Ph.D.
Další školitelé mimo členy OR
- RNDr. Miloslav Macháček, Ph.D.
- PharmDr. Anna Jirkovská, Ph.D.
- prof. PharmDr. František Štaud, Ph.D.
- doc. PharmDr. Martina Čečková, Ph.D.
5. Výzkumné skupiny vedené školiteli v rámci doktorského studijního programu Xenobiochemie a patobiochemie
Syntézy potenciálních léčiv a studium vztahů mezi jejich chemickou strukturou, biologickou aktivitou a toxicitou
Výzkum kožní bariéry
Vedoucí: prof. PharmDr. Kateřina Vávrová, Ph.D.
Studium účinků léčiv u experimentálně navozených patologických stavů
Výzkumná skupina molekulární a buněčné toxikologie
Vedoucí: prof. PharmDr. Tomáš Šimůnek, Ph.D.
Pracovní skupina biologických a lékařských věd
Vedoucí: prof. PharmDr. Petr Nachtigal, Ph.D.
Skupina patologie a farmakologie kardiovaskulárního systému | Skupina klinické fyziologie výživy a metabolismu | Skupina mikrobiologie a immunologie
Studium farmakokinetického profilu léčiv zejména s ohledem na interakce s transportními a biotransformačními proteiny a jejich význam v lékových interakcích
Výzkumná skupina pro studium reduktas z nadrodin AKR a SDR
Vedoucí: prof. Ing. Vladimír Wsól, Ph.D.
Výzkumná skupina Xenobiochemie a patobiochemie jater
Vedoucí: doc. PharmDr. Iva Boušová, Ph.D.
Výzkumná skupina pro studium mechanismů xenobiotické rezistence
Vedoucí: doc. Ing. Petra Matoušková, Ph.D.