Současná náplň předmětu navazuje na změny z konce 80. let, kdy se farmaceutická botanika ještě výrazněji profilovala jako nezaměnitelný integrální předmět farmaceutického studia. Významná dynamizace výzkumu a následně vzdělávání, poskytnutí prostoru pro fytochemii, chemotaxonomii a rostlinnou biochemii - biogenezi aktivních metabolitů byly změnami nejdůležitějšími. Výuková část systematická vycházející z fylogenetického systému se plynule obohacuje o poznatky chemotaxonomie a fytochemie a zabudovává je do přednášek a učebních textů. Rostlinná fyziologie v současnosti zúžila svůj rozsah a koncentruje pozornost na rostlinou biochemii, fyziologii přeměny látek a energií a mechanismy ovlivnění tvorby látek specializovaného metabolismu. Anatomická a morfologická část rozšiřuje poznatky botaniky středoškolské tak, aby byly aplikovatelné v dalším studiu i pro farmaceutickou praxi.