Mikrobiologie 

• Postavení mikroorganismů v živé přírodě.
• Význam mikroorganismů v ekosystémech a v koloběhu látek v přírodě.
• Význam mikroorganismů pro člověka (nemoci, biotechnologie).
• Vztahy mezi organismy. Přirozená mikroflóra člověka.
• Morfologická a biochemická charakteristika mikroorganismů (prokaryotická a eukaryotická buňka), strukturální vztahy.
• Způsoby výživy, metabolismus mikroorganismů (kvašení, dýchání)
• Výživa a růst mikroorganismů (růstové faktory, prototrofie, auxotrofie, růstová křivka).
• Patogeneze infekčních chorob. Patogenní mechanismy mikrobů. Principy protiinfekční imunity.
• Základy epidemiologie.
• ékařská mikrobiologie
• Bakteriální buňka, struktura a funkce. Morfologie bakterií. Mikroskopie bakterií.
• Genetika bakterií. Rekombinace (transdukce, transformace, konjugace). Plasmidy, transpozony.
• Klasifikace bakterií.
• Zdravotnicky významné baktérie: streptokoky, stafylokoky, meningokoky, gonokoky, pseudomonády, hemofily, enterobaktérie, bakteroidy, helikobaktery, kampylobaktery, chlamydie, riketsie, mykobaktérie, spirochety, aktinomycety a nokardie
• Profylaxe a léčebné zvládnutí bakteriálních infekcí.
• Struktura a morfologie hub. Genetika hub. Systém hub. Houbové infekce (povrchové, kožní, podkožní, systémové). Mycetismy a mykotoxikózy. Mykoalergie.
• Profylaxe a léčebné zvládnutí houbových infekcí.
• Charakteristika a struktura virů. Množení virů. Klasifikace virů. Virové infekce.
• Profylaxe a léčebné zvládnutí virových infekcí.
• Charakteristika prvoků, helmintů, kroužkovců a členovců patogenních pro člověka. Systém parazitických prvoků. helmintů, kroužkovců a členovců. Onemocnění člověka vyvolávaná prvoky, helminty, kroužkovci a členovci.
• Profylaxe a léčebné zvládnutí protozoálních infekcí a helmintóz.
• Přenašeči lidských nákaz.

Farmaceutická mikrobiologie

• Rozdělení antimikrobních látek (antibiotika, chemoterapeutika, dezinficiencia, antiseptika, konzervační látky) a jejich obecná charakteristika. Mechanismus působení antimikrobních látek a rezistence k nim.
• Přehled hlavních skupin antibakteriálních antibiotik a chemoterapeutik: beta-laktámová antibiotika (peniciliny, cefalosporiny, imipenem, monobaktámy), tetracyklíny, aminoglykosidy, makrolidy, polypetidová a glykopeptidová antibiotika, rifamyciny, antibakteriální chemoterapeutika, ostatní antibiotika.
• Antifungální antibiotika a chemoterapeutika.
• Antivirotika.
• Antiprotozoální látky, antihelmintika a repelenty.
• Přehled a charakteristika dezinfekčních, konzervačních a antiseptických prostředků: kyseliny a estery, alkoholy, aldehydy, biguanidy, halogeny, těžké kovy, peroxid a peroctová kyselina, fenoly, povrchově aktivní látky, diamidiny,barviva a chinolové deriváty.
• Testování antimikrobiálních látek in vitro a in vivo.
• Faktory ovlivňující výběr dezinfekčního, konzervačního a antiseptického prostředku.
• Znehodnocení farmaceutických přípravků mikroorganismy a zdroje kontaminace. Způsoby znehodnocení farmaceutických surovin, pomocných látek, obalů a lékových přípravků.
• Možnosti ochrany před nežádoucím působením mikroorganismů.
• Správná výrobní praxe. Kontrola kvality a sterility farmaceutických výrobků.
• Způsoby sterilizace a rezistence mikroorganismů ke sterilizačním postupům a její vyjádření.

Klinická mikrobiologie

• Úvod do klinické mikrobiologie, náplň oboru, indikace laboratorních mikrobiologických vyšetření a jejich klinická interpretace.
• Metody klinické mikrobiologie: odběr, transport, zpracování klinického materiálu a jeho evidence.
• Metody druhové identifikace mikroorganismů: mikroskopie, kultivace, histopatologie, biochemické, imunologické a molekulárně biologické metody.
• Zpracování a interpretace laboratorních výsledků. Výpočetní technika v klinické laboratoři.
• Základy hygieny a epidemiologie.
• Infekční proces, patogenní mechanismy a virulenční faktory.
• Protiinfekční imunita a její klinické implikace v terapii infekčních chorob.
• Klinické aspekty přirozené mikroflóry, selektivní dekontaminace GITu.
• Infekce respiračního traktu.
• Infekce GITu, průjmová onemocnění infekčního původu.
• Infekce CNS.
• Infekce urogenitálního systému.
• Infekce kůže a jejích adnex.
• Infekce krve.
• Sexuálně přenosné nákazy.
• Profesionální a laboratorní infekce.
• Nosokomiální infekce.
• Současné trendy ve výskytu infekčních onemocnění.
• Farmakoterapie infekčních onemocnění.
• Prevence a profylaxe infekčních onemocnění.

Aplikovaná mikrobiologie

• Genetické manipulace - možnosti výroby terapeuticky účinných látek.
• Využití mikroorganismů při výrobě organických látek (vitaminy, aminokyseliny, enzymy, apod.).
• Využití mikroorganismů k biologickému stanovení a zkoušení (citlivost k ATB, adal.).
• Využití mikroorganismů jako modelu metabolismu savčích buněk.

Praktická cvičení

• Zásady odběru a zpracování infekčního materiálu.
• Kultivační průkaz infekčního agens. Barvení mikroorganismů. Mikroskopie barvených preparátů.
• Zpracování a hodnocení klinického materiálu.
• Biochemická identifikace bakterií.
• Imunologické metody pro identifikaci mikroorganismů.
• Molekulární metody pro identifikaci mikroorganismů.
• Morfologie kvasinek a vláknitých hub potenciálně patogenních pro člověka, jejich diagnostika.
• Základy diagnostiky parazitů.
• Testování dezinfekčních prostředků.
• Základní sterilizační postupy a jejich testování.
• Metody hodnocení účinnosti antimikrobní látek.